Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP31Q70CQ4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP31Q70CQ4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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