Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms