Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms