Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD2Q6P5Q4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD2Q6P5Q4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms