Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.552e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.562e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MITD1-206ENST00000464685 3270 ntTSL 1 (best)5.19□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS4-208ENST00000533180 635 ntTSL 25.14□□□□□ -1.592e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 POT1-219ENST00000610141 405 ntTSL 25.05□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.642e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 EIF2S3-205ENST00000487075 367 ntTSL 54.67□□□□□ -1.662e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.66□□□□□ -1.662e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.672e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PLK2-214ENST00000515415 1410 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 HMBS-204ENST00000534956 547 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PLK2-203ENST00000503115 536 ntTSL 24.44□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MPHOSPH9-209ENST00000539336 1090 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.43□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 POT1-217ENST00000609106 2780 ntTSL 24.41□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 UIMC1-210ENST00000510376 466 ntTSL 24.33□□□□□ -1.722e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A3-208ENST00000547908 893 ntTSL 24.3□□□□□ -1.723e-26■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 CYFIP2-206ENST00000520424 579 ntTSL 24.27□□□□□ -1.732e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.742e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.762e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.772e-8■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 CCT5-212ENST00000514674 568 ntTSL 23.93□□□□□ -1.782e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 EIF4E-207ENST00000505829 429 ntTSL 33.76□□□□□ -1.811e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 POLA1-203ENST00000480125 580 ntTSL 33.66□□□□□ -1.822e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.852e-8■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 POT1-211ENST00000607932 1827 ntTSL 1 (best)3.45□□□□□ -1.862e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MFSD14A-202ENST00000421661 467 ntTSL 33.3□□□□□ -1.882e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.912e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 DIABLO-211ENST00000485724 560 ntTSL 23.1□□□□□ -1.911e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND4-204ENST00000374370 1955 ntTSL 23.07□□□□□ -1.922e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PCCA-214ENST00000637358 1533 ntTSL 53.06□□□□□ -1.922e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.972e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.012e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.052e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 TPM4-214ENST00000591645 653 ntTSL 31.98□□□□□ -2.092e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF451-218ENST00000515290 581 ntTSL 41.96□□□□□ -2.12e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PLK2-211ENST00000510629 591 ntTSL 21.95□□□□□ -2.12e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF451-217ENST00000510989 558 ntTSL 51.88□□□□□ -2.112e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 EIF2S3-202ENST00000423068 773 ntTSL 21.73□□□□□ -2.132e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF451-214ENST00000509071 477 ntTSL 51.12□□□□□ -2.232e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.242e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 IREB2-207ENST00000559676 973 ntTSL 50.99□□□□□ -2.252e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 RAB11FIP2-204ENST00000483413 707 ntTSL 20.67□□□□□ -2.32e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 CUL3-205ENST00000432260 587 ntTSL 30.35□□□□□ -2.352e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 CUL3-206ENST00000436172 576 ntTSL 4-0.03□□□□□ -2.412e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ALG13-212ENST00000474121 436 ntTSL 3-0.57□□□□□ -2.52e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.62e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 CLPTM1L-205ENST00000505605 386 ntTSL 210.58□□□□□ -0.727e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 CLPTM1L-206ENST00000505914 519 ntTSL 38.57□□□□□ -1.047e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 NSUN2-203ENST00000504374 3217 ntTSL 213.47□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 TCP1-206ENST00000536607 572 ntTSL 215.91■□□□□ 0.142e-11■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 CENPT-221ENST00000565713 822 ntTSL 212.5□□□□□ -0.417e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 CENPT-205ENST00000562462 1005 ntTSL 211.3□□□□□ -0.67e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.885e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 TBL1XR1-233ENST00000637659 3105 ntTSL 53.23□□□□□ -1.896e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 TBL1XR1-222ENST00000631253 4186 ntTSL 51.61□□□□□ -2.156e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.196e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 RTCB-202ENST00000463455 628 ntTSL 210.28□□□□□ -0.761e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NT5C2-213ENST00000487810 669 ntTSL 36.31□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHB2-209ENST00000544134 652 ntTSL 316.59■□□□□ 0.251e-14■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHB2-214ENST00000546217 628 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-14■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NUP58-208ENST00000466694 1854 ntTSL 513.19□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NUP58-202ENST00000381736 4332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.893e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 FOXM1-207ENST00000537018 740 ntTSL 57.42□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 BAG6-260ENST00000465348 639 ntTSL 214.95□□□□□ -0.024e-13■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 57.19□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)6.87□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 26.59□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 FRS2-207ENST00000550169 570 ntTSL 313.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 FRS2-208ENST00000550316 545 ntTSL 510.85□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 XPO4-204ENST00000490513 914 ntTSL 417.31■□□□□ 0.369e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.363e-22■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.773e-22■■■■■ 35.3
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