Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF40BQ6NWY9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40BQ6NWY9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms