Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRRC8EQ6NSJ5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms