Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms