Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIRMAQ69YN4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms