Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG16L1Q676U5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms