Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USPL1Q5W0Q7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms