Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPH4AQ5TD94 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms