Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEND3Q5T5X7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEND3Q5T5X7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms