Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C10orf55Q5SWW7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms