Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms