Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP188Q5SRE5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP188Q5SRE5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms