Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms