Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms