Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACKR1Q16570 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACKR1Q16570 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms