Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GABRA6Q16445 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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