Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms