Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CYTH1Q15438 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYTH1Q15438 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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