Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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