Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD3Q15054 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms