Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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