Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms