Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSPNQ14714 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms