Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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