Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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