Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53BQ14153 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM53BQ14153 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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