Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM29Q14134 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM29Q14134 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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