Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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COL4A6Q14031 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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COL4A6Q14031 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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COL4A6Q14031 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL4A6Q14031 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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