Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE7AQ13946 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms