Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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DDX39BQ13838 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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