Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PEX6Q13608 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PEX6Q13608 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PEX6Q13608 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PEX6Q13608 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PEX6Q13608 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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