Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PICALMQ13492 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms