Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TOP3AQ13472 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TOP3AQ13472 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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