Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MSLNQ13421 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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