Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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SEMA3FQ13275 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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SEMA3FQ13275 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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SEMA3FQ13275 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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SEMA3FQ13275 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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SEMA3FQ13275 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3FQ13275 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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