Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF6Q13247 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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