Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXF1Q12946 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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