Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN13Q12923 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms