Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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CNTN1Q12860 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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