Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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KCNMA1Q12791 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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KCNMA1Q12791 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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KCNMA1Q12791 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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KCNMA1Q12791 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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KCNMA1Q12791 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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KCNMA1Q12791 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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KCNMA1Q12791 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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KCNMA1Q12791 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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KCNMA1Q12791 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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KCNMA1Q12791 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMA1Q12791 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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