Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCAPQ12770 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCAPQ12770 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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