Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms