Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC1Q08554 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC1Q08554 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC1Q08554 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms