Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF85Q03923 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms