Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4A11Q02928 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms