Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOP2BQ02880 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms